L’Institut est composé :

• d’un siège (instance de coordination) ;
• de membres adhérents ;
• de membres associés.

Les membres adhérents sont répartis en 6 collèges :

Collège des Organisations Nationales de l’Agriculture Biologique (ONAB)
Une Organisation Nationale de l’Agriculture Biologique (ONAB) est une organisation professionnelle ou non dont le but est le développement ou la recherche en agriculture biologique ou la formation à l’agriculture biologique ou la défense des intérêts de l’agriculture biologique dont le secteur d’activités couvre le territoire français.
Les membres de ce collège sont : la FNAB, le SABD, Nature et progrès et SYNABIO

Collège des Organisations Professionnels Agricoles (OPA)
Il concerne les Organisations Représentatives Agricoles à vocation générale non syndicales.
Les membres de ce collège sont : l’APCA, la FNCIVAM, la CNMCCA et l’ACTA.

Collège des Syndicats Professionnels Agricoles
Les membres de ce collège sont : la FNSEA, les JA, la confédération paysanne, la coordination rurale.

Collège des CTR et CTS

• Un Centre Technique Régional (CTR) est une organisation professionnelle agricole spécialisée dans l’agriculture biologique. Par «spécialisée dans l’agriculture biologique», on entend au minimum que le Conseil d’Administration soit composé majoritairement (au moins la moitié) de producteurs notifiés en agriculture biologique et que les fonctions de Président, Secrétaire et Trésorier de l’association ou du syndicat soient occupées par des producteurs notifiés en agriculture biologique. Un Centre Technique Régional a une vocation généraliste de développement technique et économique de l’agriculture biologique dans une région. Un Centre Technique Régional doit être constitué et organisé au niveau de la région administrative. Le délégué d’un Centre Technique Régional à l’Assemblée Générale de l’ITAB doit être un producteur notifié en agriculture biologique.
• Un Centre Technique Spécialisé (CTS) est une organisation professionnelle ou non dont le but est la recherche-développement dans un domaine technique ou scientifique spécifique intéressant directement l’agriculture biologique. A la différence d’un Centre Technique Régional, un Centre Technique Spécialisé peut avoir une vocation d’action interrégionale. Le délégué d’un Centre Technique Spécialisé doit être un producteur notifié en agriculture biologique.
• Les délégués des membres adhérents sont des producteurs, de préférence notifiés en agriculture biologique sauf pour les structures non représentatives de la production agricole ; 
• Un membre associé est une organisation dont le but ou l’activité contribue au développement de l’agriculture biologique.